La plupart des ressources qu'un joueur obtient dans une partie sera en nettoyant les salles. Pour voir la logique derrière ça, voir Récompenses de salle terminée.
Quand la graine "KEEP AWAY" est activée, toutes les ressources vont imiter les mouvements d'Isaac.
Quand la graine "GONE SOON" est activée, toutes les ressources disparaissent vite.
Quand la graine "CAMO DROP" est activée, toutes les ressources et objets seront camouflés dans le sol.